از روی دین‌داری، 99% مردم افغانستان مسلمان هستند که حدود %90 آنان اهل سنت، 9% اهل تشیع و 1% دیگر ادیان هستند.
تا دهه ۱۸۹۰، منطقه نورستان به خاطر ساکنین‌اش با نام کافرستان (سرزمین کافرها) شناخته می‌شد. نورستانی‌ها از نژادی متمایز بودند که به باورهای روح‌باوری، چندخدایی و شمن‌باوری گرویده بودند.
مذاهب دیگری چون هندو و سیک نیز در افغانستان پیروانی دارد.
پیش از جنگ‌های ۳۰ سال گذشته، اقلیتی یهودی نیز در افغانستان و به ویژه شهر هرات وجود داشتند که امروزه بیشتر آنان به اسرائیل رفته‌اند.
همچنین بین 10000 تا 20000 نفر از پیروان مسیحیت در این کشور زندگی می‌کنند.